Η L-Cysteine χρησιμοποιείται κυρίως στην ιατρική, στα καλλυντικά, στη βιοχημική έρευνα. Χρησιμοποιείται σε υλικά ψωμιού για την προώθηση του σχηματισμού γλουτένης και την προώθηση της ζύμωσης, της μούχλας και της πρόληψης της γήρανσης. Χρησιμοποιείται σε φυσικούς χυμούς για να αποτρέψει την οξείδωση της βιταμίνης C και να αποτρέψει το χυμό να γίνει καφέ. Το προϊόν έχει αποτέλεσμα αποτοξίνωσης, μπορεί να χρησιμοποιηθεί για δηλητηρίαση από ακρυλονιτρίλιο, αρωματική οξέωση.
Η ακετυλοκυστεΐνη, επίσης γνωστή ως Ν-ακετυλοκυστεΐνη ή Ν-ακετυλο-L-κυστεΐνη (NAC), είναι ένα φάρμακο που χρησιμοποιείται για τη θεραπεία της υπερδοσολογίας και για να χαλαρώσει την παχιά βλέννα όπως στην κυστική ίνωση ή τη χρόνια αποφρακτική πνευμονοπάθεια.